Sejak didirikan di Yogyakarta pada tahun 1912, Muhammadiyah merupakan suatu gerakan sosial-keagamaan yang modern. Pertama, Muhammadiyah merupakan suatu gerakan yang terorganisasi dengan baik, kedua, aktivitasnya menggunakan sistem modern, terutama dalam aktivitas keagamaan, pendidikan, dan sosial. Sejak mulai dikembangkan Muhammadiyah berkonsentrasi pada pengembangan sumber daya manusia seperti terlihat pada program pendidikan, kesehatan dan tabligh. Dalam usia lebih dari 90 tahun, Muhammadiyah telah berkembang secara signifikan terutama di bidang pendidikan. Sejalan dengan semangat "amar ma’ruf nahi munkar" yang merupakan dasar gerakan Muhammadiyah,

pengembangan pendidikan di bawah persyarikatan Muhammadiyah telah mencapai 32 universitas, 52 sekolah menengah, 45 akademi dan 3 politeknik yang tersebar di seluruh Indonesia.

Pada Maret 1981, melalui perjuangan keras beberapa aktivis Muhammadiyah seperti Drs. H. Mustafa Kamal Pasha, Drs. M. Alfian Darmawan, Hoemam Zainal, SH., Brigjen. TNI (Purn.) Drs. H. Bakri Syahid, K.H. Ahmad Azhar Basyir, MA., Ir. H. M. Dasron Hamid, M. Sc., H. M. Daim Saleh, Dr. M. Amien Rais, H.M.H. Mawardi, Drs. H. Abdul Rosyad sholeh, Zuber Kohari, Ir.H.Basit Wahid, serta didukung oleh Ketua Pimpinan Pusat Muhammadiyah saat itu K.H. AR. Fakhruddin dan Ketua Pimpinan Wilayah Muhammadiyah DIY H.Mukhlas Abror, secara resmi didirikan Universitas Muhammadiyah Yogyakarta, yang kemudian berkembang sampai saat ini.

Saat ini UMY mempunyai 7 fakultas strata 1 yaitu fakultas pertanian, fakultas ekonomi, fakultas teknik, fakultas agama Islam, fakultas hukum, fakultas kedokteran, fakultas ilmu sosial dan ilmu politik, dan satu fakultas strata 2 dengan program studi magister manajemen dan magister studi Islam.

VISI 

Menjadi universitas yang berorientasi ke masa depan dengan bertumpu pada penguatan iman dan taqwa kepada Allah SWT serta penguasaan ilmu pengetahuan dan teknologi, sehingga dapat menjadi pusat keunggulan yang merupakan kebanggaan warga Muhammadiyah, Umat Islam dan Bangsa Indonesia

MISI 

Melalui pengembangan pendidikan, penelitian dan pengabdian pada masyarakat, UMY dapat berperan aktif didalam proses pembangunan bangsa maupun pencerahan umat manusia, serta dapat melahirkan sarjana yang menguasai ilmu pengetahuan dan teknologi di atas landasan iman dan taqwa yang kokoh, sehingga menjadi insan mandiri, berwawasan luas, sadar akan keberadaannya dan bermanfaat bagi masyarakat Indonesia yang majemuk, ikhlas dan bersungguh-sungguh di dalam melaksanakan tugas Amar Ma’ruf Nahi Munkar