Berdasarkan Peraturan Menteri Riset Teknologi dan Pendidikan Tinggi (Permenristek) No. 44/2015 tentang Standar Nasional Pendidikan Tinggi, Program Doktor Psikologi Pendidikan Islam Pascasarjana Universitas Muhammadiyah Yogyakarta telah menerapkan kurikulum berbasis KKNI. Beban studi program Doktor sebanyak 42 SKS. Sebaran kurikulum dapat dilihat di tautan berikut.
Program Studi Doktor Psikologi Pendidikan Islam Universitas Muhammadiyah Yogyakarta mendorong terwujudnya lulusan doktor yang menguasai ilmu pengetahuan, berakhlak mulia, berwawasan global, mampumengimplementasikan nilai-nilai Islam dan mengembangkan kompetensi keilmuannya untuk meningkatkan kesejahteraan serta kemaslahatan umat manusia.
Sebagai program studi unggulan, Program Studi Doktor Psikologi Pendidikan Islam memiliki outcomes program yang mampu membangun integrasi dan interkoneksi ilmu pengetahuan dan teknologi dengan nilai-nilai Islam. Selain itu juga sangat konsens pada pengembangan keilmuan Psikologi Pendidikan Islam melalui pengadaan forum-forum ilmiah dan mempublikasikan hasil riset pada jurnal nasional dan internasional bereputasi.